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<dcvalue element="contributor" qualifier="author">Binh&#x20;Thanh&#x20;Nguyen</dcvalue>
<dcvalue element="contributor" qualifier="author">Pyun,&#x20;Jae-Chul</dcvalue>
<dcvalue element="contributor" qualifier="author">Lee,&#x20;Sang-Guk</dcvalue>
<dcvalue element="contributor" qualifier="author">Kang,&#x20;Min-Jung</dcvalue>
<dcvalue element="date" qualifier="accessioned">2024-01-19T19:31:04Z</dcvalue>
<dcvalue element="date" qualifier="available">2024-01-19T19:31:04Z</dcvalue>
<dcvalue element="date" qualifier="created">2021-09-04</dcvalue>
<dcvalue element="date" qualifier="issued">2019-09</dcvalue>
<dcvalue element="identifier" qualifier="issn">2045-2322</dcvalue>
<dcvalue element="identifier" qualifier="uri">https:&#x2F;&#x2F;pubs.kist.re.kr&#x2F;handle&#x2F;201004&#x2F;119652</dcvalue>
<dcvalue element="description" qualifier="abstract">Focal&#x20;adhesion&#x20;kinase&#x20;(FAK)&#x20;is&#x20;a&#x20;125&#x20;kDa&#x20;protein&#x20;recruited&#x20;as&#x20;a&#x20;participant&#x20;in&#x20;focal&#x20;adhesion&#x20;dynamics&#x20;and&#x20;serves&#x20;as&#x20;a&#x20;signaling&#x20;scaffold&#x20;for&#x20;the&#x20;assembly&#x20;and&#x20;subsequent&#x20;maturation&#x20;of&#x20;focal&#x20;contact.&#x20;Identification&#x20;of&#x20;new&#x20;FAK&#x20;binding&#x20;proteins&#x20;could&#x20;reveal&#x20;potential&#x20;signaling&#x20;targets&#x20;and&#x20;contribute&#x20;to&#x20;further&#x20;development&#x20;of&#x20;therapeutic&#x20;drugs&#x20;in&#x20;the&#x20;treatment&#x20;of&#x20;colon&#x20;cancer.&#x20;Here,&#x20;we&#x20;applied&#x20;a&#x20;functional&#x20;proteomic&#x20;strategy&#x20;to&#x20;identify&#x20;proteins&#x20;that&#x20;interact&#x20;with&#x20;FAK&#x20;in&#x20;human&#x20;colon&#x20;cancer&#x20;cell&#x20;line&#x20;HCT-116.&#x20;Proteins&#x20;were&#x20;targeted&#x20;by&#x20;coimmunoprecipitation&#x20;with&#x20;an&#x20;anti-FAK&#x20;antibody&#x20;and&#x20;resolved&#x20;on&#x20;1D-SDS-PAGE.&#x20;The&#x20;gel&#x20;was&#x20;excised,&#x20;reduced,&#x20;alkylated,&#x20;and&#x20;trypsin&#x20;digested.&#x20;Tryptic&#x20;peptides&#x20;were&#x20;separated&#x20;by&#x20;nano-LC-MS&#x2F;MS&#x20;by&#x20;an&#x20;LTQ-Orbitrap-Velos&#x20;spectrometer.&#x20;We&#x20;identified&#x20;101&#x20;proteins&#x20;in&#x20;the&#x20;immunocomplex&#x20;under&#x20;epithelial&#x20;growth&#x20;factor&#x20;(EGF)&#x20;stimulation.&#x20;Three&#x20;proteins,&#x20;zyxin,&#x20;nesprin-1,&#x20;and&#x20;desmoplakin,&#x20;were&#x20;discovered&#x20;and&#x20;validated&#x20;using&#x20;reciprocal&#x20;immunoprecipitation&#x20;and&#x20;Western&#x20;blot&#x20;analysis.&#x20;Then,&#x20;we&#x20;sought&#x20;to&#x20;study&#x20;the&#x20;biological&#x20;relevance&#x20;of&#x20;these&#x20;proteins&#x20;by&#x20;siRNA&#x20;transfection&#x20;of&#x20;HCT-116&#x20;cells.&#x20;According&#x20;to&#x20;the&#x20;results,&#x20;zyxin&#x20;might&#x20;play&#x20;a&#x20;central&#x20;role&#x20;as&#x20;an&#x20;upstream&#x20;regulator&#x20;to&#x20;mediate&#x20;critical&#x20;cancer-related&#x20;signaling&#x20;pathways.&#x20;Zyxin&#x20;and&#x20;nesprin-1&#x20;depletion&#x20;significantly&#x20;impaired&#x20;cell&#x20;migration&#x20;and&#x20;invasion&#x20;capabilities.&#x20;Additionally,&#x20;we&#x20;performed&#x20;ELISA&#x20;assays&#x20;on&#x20;serum&#x20;samples&#x20;from&#x20;patients&#x20;with&#x20;colon&#x20;cancer&#x20;instead&#x20;of&#x20;cell&#x20;models&#x20;to&#x20;quantify&#x20;the&#x20;protein&#x20;levels&#x20;of&#x20;zyxin&#x20;and&#x20;nesprin-1.&#x20;Our&#x20;results&#x20;suggested&#x20;that&#x20;zyxin&#x20;and&#x20;nesprin-1&#x20;are&#x20;not&#x20;only&#x20;promising&#x20;therapeutic&#x20;targets&#x20;but&#x20;also&#x20;potential&#x20;diagnostic&#x20;biomarkers&#x20;for&#x20;colon&#x20;cancer.</dcvalue>
<dcvalue element="language" qualifier="none">English</dcvalue>
<dcvalue element="publisher" qualifier="none">Nature&#x20;Publishing&#x20;Group</dcvalue>
<dcvalue element="title" qualifier="none">Identification&#x20;of&#x20;new&#x20;binding&#x20;proteins&#x20;of&#x20;focal&#x20;adhesion&#x20;kinase&#x20;using&#x20;immunoprecipitation&#x20;and&#x20;mass&#x20;spectrometry</dcvalue>
<dcvalue element="type" qualifier="none">Article</dcvalue>
<dcvalue element="identifier" qualifier="doi">10.1038&#x2F;s41598-019-49145-6</dcvalue>
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<dcvalue element="identifier" qualifier="bibliographicCitation">Scientific&#x20;Reports,&#x20;v.9</dcvalue>
<dcvalue element="citation" qualifier="title">Scientific&#x20;Reports</dcvalue>
<dcvalue element="citation" qualifier="volume">9</dcvalue>
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