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<dcvalue element="contributor" qualifier="author">Win,&#x20;Theint&#x20;Theint</dcvalue>
<dcvalue element="contributor" qualifier="author">Song,&#x20;Kyung&#x20;Guen</dcvalue>
<dcvalue element="date" qualifier="accessioned">2024-01-12T06:33:44Z</dcvalue>
<dcvalue element="date" qualifier="available">2024-01-12T06:33:44Z</dcvalue>
<dcvalue element="date" qualifier="created">2023-09-08</dcvalue>
<dcvalue element="date" qualifier="issued">2023-10</dcvalue>
<dcvalue element="identifier" qualifier="issn">0045-6535</dcvalue>
<dcvalue element="identifier" qualifier="uri">https:&#x2F;&#x2F;pubs.kist.re.kr&#x2F;handle&#x2F;201004&#x2F;79812</dcvalue>
<dcvalue element="description" qualifier="abstract">This&#x20;study&#x20;assessed&#x20;the&#x20;components&#x20;of&#x20;anaerobically&#x20;digested&#x20;sludge,&#x20;activated&#x20;sludge,&#x20;and&#x20;microbial&#x20;and&#x20;extracellular&#x20;polymeric&#x20;substance&#x20;(EPS)&#x20;enzymes&#x20;to&#x20;identify&#x20;the&#x20;mechanisms&#x20;underlying&#x20;nitrogen&#x20;removal&#x20;and&#x20;soil&#x20;regeneration.&#x20;16S&#x20;rRNA&#x20;gene&#x20;amplicon-based&#x20;sequencing&#x20;was&#x20;used&#x20;to&#x20;determine&#x20;the&#x20;microbial&#x20;community&#x20;composition&#x20;and&#x20;the&#x20;related&#x20;National&#x20;Center&#x20;for&#x20;Biotechnology&#x20;Information&#x20;(NCBI)&#x20;protein&#x20;database&#x20;was&#x20;used&#x20;to&#x20;construct&#x20;a&#x20;conventional&#x20;library&#x20;from&#x20;the&#x20;observed&#x20;community.&#x20;EPS&#x20;components&#x20;were&#x20;identified&#x20;using&#x20;gel-free&#x20;proteomic&#x20;(Liquid&#x20;Chromatography&#x20;with&#x20;tandem&#x20;mass&#x20;spectrometry-LC&#x2F;MS&#x2F;MS)&#x20;methods.&#x20;Alginate-like&#x20;EPS&#x20;from&#x20;aerobically&#x20;activated&#x20;sludge&#x20;have&#x20;strong&#x20;potential&#x20;for&#x20;soil&#x20;aggregation&#x20;and&#x20;water-holding&#x20;capacity,&#x20;whereas&#x20;total&#x20;EPS&#x20;from&#x20;anaerobic&#x20;sludge&#x20;have&#x20;significant&#x20;potential&#x20;for&#x20;ammonia&#x20;removal&#x20;under&#x20;salt&#x20;stress.&#x20;Fourier&#x20;transform&#x20;infrared&#x20;spectroscopy&#x20;(FTIR)&#x20;revealed&#x20;that&#x20;both&#x20;EPS&#x20;may&#x20;contain&#x20;proteins,&#x20;carbohydrates,&#x20;humic&#x20;compounds,&#x20;uronic&#x20;acid,&#x20;and&#x20;DNA&#x20;and&#x20;determined&#x20;the&#x20;presence&#x20;of&#x20;O？H,&#x20;N？H,&#x20;C？N,&#x20;Cdouble&#x20;bondO,&#x20;and&#x20;C？H&#x20;functional&#x20;groups.&#x20;These&#x20;results&#x20;demonstrate&#x20;that&#x20;the&#x20;overall&#x20;enzyme&#x20;activity&#x20;may&#x20;be&#x20;inactivated&#x20;at&#x20;30&#x20;g&#x20;L-1&#x20;of&#x20;salinity.&#x20;An&#x20;annotation&#x20;found&#x20;in&#x20;Kyoto&#x20;Encyclopedia&#x20;of&#x20;Genes&#x20;and&#x20;Genomes&#x20;(KEGG)-&#x20;KEGG&#x20;Automatic&#x20;Annotation&#x20;Server&#x20;(KAAS)&#x20;revealed&#x20;that&#x20;the&#x20;top&#x20;two&#x20;metabolic&#x20;activities&#x20;in&#x20;the&#x20;EPS&#x20;generated&#x20;from&#x20;the&#x20;anaerobic&#x20;sludge&#x20;were&#x20;methane&#x20;and&#x20;nitrogen&#x20;metabolism.&#x20;Therefore,&#x20;we&#x20;focused&#x20;on&#x20;the&#x20;nitrogen&#x20;metabolism&#x20;reference&#x20;map&#x20;00910.&#x20;EPS&#x20;from&#x20;the&#x20;anaerobically&#x20;digested&#x20;sludge&#x20;exhibited&#x20;nitrate&#x20;reductase,&#x20;nitrite&#x20;reductase,&#x20;and&#x20;dehydrogenase&#x20;activities.&#x20;Assimilatory&#x20;nitrate&#x20;reduction,&#x20;denitrification,&#x20;nitrification,&#x20;and&#x20;anammox&#x20;removed&#x20;ammonia&#x20;biochemically.&#x20;The&#x20;influence&#x20;of&#x20;microbial&#x20;extracellular&#x20;metabolites&#x20;on&#x20;water-holding&#x20;capacity&#x20;and&#x20;soil&#x20;aggregation&#x20;was&#x20;also&#x20;investigated.&#x20;The&#x20;KAAS-KEGG&#x20;annotation&#x20;server&#x20;was&#x20;used&#x20;to&#x20;identify&#x20;the&#x20;main&#x20;enzymes&#x20;in&#x20;the&#x20;activated&#x20;sludge-derived&#x20;alginate-like&#x20;extracellular&#x20;EPS&#x20;(ALE-EPS)&#x20;samples.&#x20;These&#x20;include&#x20;hydrolases,&#x20;oxidoreductases,&#x20;lyases,&#x20;ligases,&#x20;and&#x20;transporters,&#x20;which&#x20;contribute&#x20;to&#x20;soil&#x20;fertility&#x20;and&#x20;stability.&#x20;This&#x20;study&#x20;improves&#x20;our&#x20;understanding&#x20;of&#x20;the&#x20;overall&#x20;microbial&#x20;community&#x20;structure&#x20;and&#x20;the&#x20;associated&#x20;biochemical&#x20;processes,&#x20;which&#x20;are&#x20;related&#x20;to&#x20;distinct&#x20;functional&#x20;genes&#x20;or&#x20;enzymes&#x20;involved&#x20;in&#x20;nitrogen&#x20;removal&#x20;and&#x20;soil&#x20;aggregation.&#x20;In&#x20;contrast&#x20;to&#x20;conventional&#x20;methods,&#x20;microbial&#x20;association&#x20;with&#x20;proteomics&#x20;can&#x20;be&#x20;used&#x20;to&#x20;investigate&#x20;ecological&#x20;relationships,&#x20;establishments,&#x20;key&#x20;player&#x20;species,&#x20;and&#x20;microbial&#x20;responses&#x20;to&#x20;environmental&#x20;changes.&#x20;Linking&#x20;the&#x20;metagenome&#x20;to&#x20;off-gel&#x20;proteomics&#x20;and&#x20;bioinformatics&#x20;solves&#x20;the&#x20;problem&#x20;of&#x20;analyzing&#x20;metabolic&#x20;pathways&#x20;in&#x20;complex&#x20;environmental&#x20;samples&#x20;in&#x20;a&#x20;cost-effective&#x20;manner.</dcvalue>
<dcvalue element="language" qualifier="none">English</dcvalue>
<dcvalue element="publisher" qualifier="none">Pergamon&#x20;Press&#x20;Ltd.</dcvalue>
<dcvalue element="title" qualifier="none">Metagenomics&#x20;and&#x20;proteomics&#x20;profiling&#x20;of&#x20;extracellular&#x20;polymeric&#x20;substances&#x20;from&#x20;municipal&#x20;waste&#x20;sludge&#x20;and&#x20;their&#x20;application&#x20;for&#x20;soil&#x20;and&#x20;water&#x20;bioremediation</dcvalue>
<dcvalue element="type" qualifier="none">Article</dcvalue>
<dcvalue element="identifier" qualifier="doi">10.1016&#x2F;j.chemosphere.2023.139767</dcvalue>
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<dcvalue element="identifier" qualifier="bibliographicCitation">Chemosphere,&#x20;v.339</dcvalue>
<dcvalue element="citation" qualifier="title">Chemosphere</dcvalue>
<dcvalue element="citation" qualifier="volume">339</dcvalue>
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