펩티드 아미노기 치환용 화합물 엔－메틸피페라진 아세트산의 동위 이성질체 및 질량 분석기를 이용한 펩티드 정량 방법

Abstract

본 발명은 펩티드 아미노기 치환용 화합물 엔－메틸 피페라진 아세트산의 동위 이성질체 및 질량 분석기를 이용한 펩티드 정량 방법으로, 두 개의 단백질 또는 펩티드 복합체에서 개별 단백질 또는 펩티드를 동정하면서 동시에 상대정량하는 방법에 관한 것이다. 구체적으로 엔-메틸피페라진 아세트산 엔-하이드록시숙시마이드 에스테르(N-methylpiperazine acetic acid N-hydroxysuccimide ester)및 이의 동위이성질체(isotopologue)를 준비하고 비교하고자 하는 시료가 단백질 복합체인 경우 따로따로 단백질 분해효소를 이용하여 펩티드로 절단한 뒤, 펩티드 복합체 각각에 대해 상기 시약의 서로 다른 isotopologue로 표지한 다음, 서로 섞어서 질량분석기를 이용하여 질량분석 스펙트럼과 탠덤질량분석스펙트럼을 번갈아가며 스캔하여, 일반 질량분석스펙트럼에서는 개별 펩티드의 isotopologue 유도체 신호세기의 값으로 상대정량하고, 탠덤질량분석스펙트럼으로는 해당 펩티드를 동정하므로써 처음 단백질복합체 또는 펩티드복합체 시료에 들어 있는 개별단백질 또는 펩티드의 양을 시료간에 서로 상대비교할 수 있게 하는 방법이다. 본 발명의 새로운 방법은 기존 방법의 단점을 보완한 효과적인 방법으로 탠덤질량분석스펙트럼상에서 b형 이온과 y형 이온이 골고루 나오게 하여 높은 신뢰도의 동정과 정량을 가능케 한다.